10月27日，齐军集中十门火炮，密集轰击肇庆东城，至傍晚六，此前遭到清军破坏严重的东城一段城墙现垮塌。齐军指挥官石广汉遂命令忠义军发起突击，攻城中。

清军主力一路往西攻去后，留韶州总兵光明三千余剿灭李元胤残。而郑军待清军离开后，一千五百官兵随即驻残破的肇庆城。

至此，清军攻两广主力大被歼，而攻至广西钦州附近的郝尚久八千余兵则彻底成为孤军，覆灭也是时间早晚的事。

11月2日，原大顺军将领袁宗第、李来亨二人领四千余兵从梧州一路追击而来，抵肇庆城，与齐军顺利会师。

不论是拥有的人，还是积存财富，广东均数倍于云贵广西等地，大西军据有此地，将极大的提升和促他们未来的战争潜力。

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待到了八月底，清廷发来调兵文书，急令尚可喜、耿继茂等清军主力，迅速攻广西，击大西军后路，为日益艰难的湖广战场缓解一压力。

一个多月前，尚可喜、耿继茂集三万余大军勐攻肇庆，耗费十余日，折损官兵三千余人，才将这座城攻克，李元胤引残兵千余至罗定州（今广东云浮市），继续抵抗。

接来，齐军将动师舰队合李定国大军，扫广东北和东地区，剿灭清军和郑军残余，彻底将这个富庶的省份纳大西军的直接控制之。

11月1日，清军尚可喜、耿继茂所清军三千余陆续现在肇庆城，整个队伍辎重皆失，军械也丢弃毁损近半。

借着清军刻意放的时机，李元胤遂命城中军民加城池的防御力度，特意修葺了四周的城墙，增建炮台数座、窝铺六十余间，城之上增添炮台两座，并拆除了离城四尺以的所有房屋，用以增置楼堞。

当齐军列队城时，尚可喜叹一声，解腰间佩剑，掷于地上，命全军跪地乞降。

然而，击灭来袭郑军后，齐军并未趁势发起攻击，而是好整以暇地继续安守大营，养蓄锐。

次日，齐军一边着令民夫拖拽火炮至城，准备攻肇庆城，一边让两名来自广州的郑军俘虏城去劝降守军。

10月29日，清军韶州总兵光明闻之肇庆城破，立即置罗定州李元胤明军不顾，往州（今广东茂名市）逃去。

待正午时分，两名劝降的郑军俘虏城告知，因守城将领和分官兵家属皆在福建，不敢未战即降，否则可能祸及家人。

难不成，又钻山老林，逃往江西？若如此，最终能有几人活命。

带队的法，领兵的将领有些门。……咱们还是谨慎一为好。”一名战术参谋提醒。

“营，我这就去安排！”那名战术参谋闻言，顿时心领神会。

“俺晓得。”石广汉看着远肇庆城，若有所思地说：“城中守军将领叫施琅，是近几年来郑军窜得最快的将领之一。听说，十几年前攻台湾荷兰据的时候，他就表现得非常亮，让郑军第一时间攻赤嵌城，取得了稳固的立足，为最后全取台湾立功。此人打仗善于用奇，还喜险。你说，到了晚上，他会不会偷偷摸城来，对我们发动一次夜袭？”

耿继茂挣扎良久，亦不甘地抛手中刀，跪倒在尚可喜的后。

10月26日，夜，肇庆城守军主将施琅遣七百兵，夜袭城外齐军大营。但遭到齐军的心设伏，几乎全军覆没。肇庆城随即全城警戒，防备齐军趁势攻城。

在看到肇庆城几面飘扬的赤黄龙旗和黑衣军时，清军上均绝望的神。

更重要的是，此战还一举全歼清军汉军八旗尚、耿两，若是再加上半年前被李定国打得抱鼠窜的孔有德，清军最能打的三王，均栽在两广之地。整个南方局势，亦为之一变，使得大明辖地拥有了更为宽广的战略纵。

待夜幕降临时，齐军基本清除郑军的反击。然而，令人失望的是，郑军主将施琅趁着夜，逃肇庆，不知所踪。

10月25日，齐军突然攻至肇庆，当日午后，迅速夺取城，掐断了郑军南逃路线。

别说城中驻守的是令清军最为忌惮的齐国军队，就是普通的一千多明军，也足以让狼狈逃窜至此的清军束手无策。没有辎重补给，更没有攻城械，而且师老兵疲，军械不足，如何能跨过肇庆城。

因为清廷将广东改封郑芝龙，使得两人大为不满，便借粮饷不足，队需要休整为由，簇聚在广州附近，迟迟未攻肇庆。