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冬日的
穿过研究室的窗
照到玛修背上,无视室外零
十二度低温的事实蒸着微微
意。玛修左手
指轻敲上午刚刚送来的
碟外包装,右手
指蜷曲着用第二节指节撑着颧骨末端,右手拇指则勾住他外扩的
頷。他盯着
前的双萤幕,因为一再
现的一组数字微微皱起眉
。
碟里的资料是他先前委託外包厂商,
行斑
鱼基因定序的成果。因为基因样本量很少,厂商会先将原本的dna样本用酶切断、
行聚合酶链式反应(pcr)后才定
序列。因此玛修收到的资料是数万,甚至数百万串不等
、由代表不同硷基对的字母排列而成的字串。他必须将这些零碎的字串比对拼贴,最后现
序列原本的样貌。
不过这并不是让他皱眉的原因。定序的技术和重组字串的方法已经非常成熟了。像斑
鱼这
被研究透彻的模式动
,要
大紕漏并不容易。
让他
到担忧的事
是斑
鱼粒线
(mitochondrion)的基因序列
度和线虫的一模一样。
当然不是指原始序列本
的
度一模一样。相较于细胞
的基因序列,粒线
的基因序列突变得更快,而且突变速率稳定,时常被用来评估生
的演化
程以及
间的亲缘关係。线虫和斑
鱼两
生
天差地远,牠们粒线
的基因序列自然不同。
问题
在玛修手边的理论。他正在研究粒线
基因序列的突变与演化。如果粒线
的
共生假说──我们的真
生
祖先在二十亿年前收服了一
原
生
当「小弟」──是正确的,那么现在所有生
的粒线
硷基排列应该都源自同一条序列。由此,玛修和他的导师正着手建构一
演算法,希望能直接从生
当前的粒线
基因序列推算始祖序列的型态,并依照两者之间的差异将各个生
安在演化树上的相对位置──实现生
演化树的大一统。
可是当玛修完成第一版演算法,并且尝试代
资料库中的已有的粒线
基因序列资料,他发现每
生
最后给
的始祖序列
度都一样──12,317±1对硷基。
不只线虫和斑
鱼,果蝇、文昌鱼和小鼠都一样。现在就连使用他们实验室自己培育的斑
鱼的基因序列
行分析,结果也还是完
的12,317对硷基。
完
的结果难
不完
吗?
当然不!玛修用的方法看来复杂华丽,可是脱不
成山的假设和它外
的本质。不同的
应该要得
大致相同但细节迥异的结果。不停
现同一组数字,在同儕审查中只会被视为程式码
错的徵兆。
不过他已经
了三个月,一行一行、一字一字检查他的程式码不
数遍。他甚至邀请了国外另一间大学的研究团队依据他的理论
行独立研究,由文化背景迥异的研究员从
实现一次演算法,得
的结果还是一模一样。
那天晚上他又到了校园附近的酒吧买醉,不过
旁喧闹着的、无忧无虑的大学
学生让他愁上加愁。他趁着醉意打电话给前女友诉苦。前女友没有接,他就一直打、一直打……
「都
到这样,你把文章送
去就是了。」
玛修想和前女友復合的奋斗故事说到一半被无
打断。他沉浸在回忆里,愣了一会儿才发现
丽正在等待他的回应。
「什么?」
「我说,你都
到这样了,」
丽把叉
尖端
嘴里,用
尖品嚐沙拉酱
的酸甜味
,「不是应该先把文章送
去,看看期刊的审查委员有什么意见再说吗?说不定他们
本不在意这
小事。」
玛修有
尷尬,他搔着后脑,说:「啊,现在想起来是这样没错。不过那时候总想着要把研究
得完
。毕竟那篇文章送
去,大概整个生
资讯学都会被翻过来吧?」
玛修用轻松的语调讲着一般研究人员一辈
都不敢奢望的经歷。不过卡琳对于玛修的藉
并不买单,她靠到
丽
边悄声说
:「他只是想打给他前女友。」
「所以呢?」
丽完全不遮掩,单刀直
地问玛修:「你前女友有接电话吗?」
「不
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